Thực hiện triển khai hoạt động các chương trình mục tiêu y tế quốc gia về phòng, chống bệnh truyền nhiễm; Tiêm chủng mở rộng; tiêm phòng bệnh dại; phòng chống HIV/AIDS; điều trị Methadol; Phòng chống lao, nhiễm khuẩn hô hấp cấp tính; Phòng chống Sốt rét-KSTCT; Phòng chống các yếu tố nguy cơ tác động lên sức khỏe, bệnh chưa rõ nguyên nhân phát sinh lây lan thành dịch bệnh; Bệnh tâm thần; Phòng chống Phong da liễu; hoạt động phòng chống mù lòa; điều trị triển khai các chương trình mục tiêu, dự án (nếu có).

Thực hiện các hoạt động kiểm tra, giám sát, hỗ trợ đối với các trạm y tế xã, thị trấn.

Thực hiện các nhiệm vụ khác do Giám đốc Trung tâm Y tế huyện phân công.